医療費控除とは、1年間で納税者本人とその家族の医療費が一定の額を超える場合に受けられる所得控除です。所得控除を受けるには確定申告が必要ですが、医療費控除の申請はスマホでも手続きできます。

スマホでの確定申告は、マイナンバーカードやマイナポータル連携を活用すればより手軽に申請が可能です。医療費や所得などの情報が自動入力されるため、初めて確定申告する方にも適しています。

本記事では、スマホで医療費控除を申請するときのやり方や事前準備について解説するため、ぜひ参考にしてください。

• 医療費控除とは？
• 医療費控除の要件
• 医療費控除の対象となる費用・ならない費用
• 医療費控除とセルフメディケーション税制の違い
• スマホで確定申告をする方法
• スマホで医療費控除を申請するための事前準備
• マイナンバーカードを作成する
• マイナポータルの利用者登録・e-Taxとの連携を行う
• 申告に必要な書類を準備する
• スマホから医療費控除を申請するやり方（手順）
• ① 確定申告書等作成コーナーから申告書の作成を開始する
• ② 収入・所得金額を入力する
• ③ 「控除等入力」画面で医療費控除の入力・確認を行う
• ④ 税額控除・住民税等に関する事項を入力する
• ⑤ 計算結果を確認したら住所・氏名・マイナンバーを入力する
• ⑥ 申告書を送信する
• まとめ
• 確定申告を簡単に終わらせる方法
• よくある質問

医療費控除とは、所得控除のひとつです。所得控除は、所得税の課税対象となる収入から差し引くことができる金額で、税の負担を軽減します。納税者本人および納税者と生計を同じくする家族が、一定以上の医療費を支払った場合に医療費控除を受けられます。

原則、所得控除を受けるには確定申告が必要です。会社員の場合は、毎月の給料から概算の所得税が天引きされて年末調整で過不足を算出するため、確定申告は必要ありません。

ただし、医療費控除は年末調整の対象外です。そのため、会社員で医療費控除を受ける場合は、自分で確定申告を行わなければなりません。

医療費控除や年末調整について詳しく知りたい方は、以下の記事もご確認ください。

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医療費控除とは？対象となる費用や申請方法について解説
確定申告は年末調整をしていてもするべき？申告が必要になるケースを解説

医療費控除は自分だけではなく、配偶者やそのほかの親族の医療費も対象になる場合があります。医療費控除の要件は以下の2つです。

医療費控除の対象となる金額は最高200万円で、次の計算式で算出します。

「保険金などで補てんされる金額」には以下が挙げられます。

ただし、保険金などで補てんされる金額は、その給付の目的である医療費の金額を上限として差し引きます。そのため、引ききれない金額が生じてもほかの医療費から差し引く必要はありません。

その年の総所得金額等が200万円に満たない場合は、10万円ではなく、総所得金額等の5％の金額を差し引きます。

医療費控除では、以下の通り、対象となる費用と対象外の費用があります。

原則、健康診断の費用は対象外ですが、診断の結果、重大な疾病が見つかり治療を行った場合は医療費控除の対象となります。

医療費控除には、特例として「セルフメディケーション税制」があります。セルフメディケーション税制とは、健康の保持増進・疾病の予防のために、特定の医薬品を購入した場合に受けられる制度です。

通常の医療費控除とセルフメディケーション税制の主な違いは下表の通りです。

セルフメディケーション税制では、以下の計算式で医療費控除額を算出します。

特定一般用医薬品購入費とは、以下の内容に該当する医薬品です。

なお、通常の医療費控除とセルフメディケーション税制を併用することはできません。年間で支払った費用の内容を考慮し、控除額の大きい方を選択しましょう。

スマホやパソコンを使ってオンラインで確定申告を行うには、「e-Tax」を利用する必要があります。e-Taxとは、所得税などの国税に関する各種手続きをインターネット上で行えるシステムです。

確定申告書をe-Taxで送信するには、以下の2種類の方法があります。

マイナンバーカード方式では、マイナンバーカードを読み取り、利用者証明用電子証明書の暗証番号を入力してe-Taxにログインします。

ID・パスワード方式は、税務署で本人確認手続きを行うことで発行されるe-Tax用のID・パスワードを利用する方法です。

ただし、ID・パスワード方式は、マイナンバーカードが普及するまでの暫定的な対応です。そのため今回は、マイナンバーカード方式によってスマホで医療費控除を申請する方法を解説します。

スマホでの確定申告をスムーズに進めるためは、事前準備を済ませておかなくてはなりません。必要な事前準備は、以下の3つです。

「マイナンバーカードの作成」は時間を要する可能性があるため、確定申告の時期に焦らないように余裕をもって準備しましょう。

マイナンバーカードは、以下のいずれかの方法で申請できます。

オンライン申請の場合、スマホもしくはパソコンで必要事項を入力・送信します。申請が完了したら、市区町村から交付通知書が届くのを待ちましょう。

交付通知書が発送されるまでには約1ヶ月かかるため、マイナンバーカードを持っていない人は早めに申請手続きを行ってください。

マイナポータル連携とは、確定申告で必要な控除証明書などのデータを「マイナポータル」経由で一括取得し、確定申告書に自動入力する機能です。マイナポータルとe-Taxを連携すれば、データを入力・管理する手間を省けるうえ、入力ミスを減らす効果が期待できます。

政府が運営するオンラインサービスである「マイナポータル」を使うには、まず以下の手順でマイナポータルの利用者登録を完了しましょう。

e-Taxへのログイン時にもマイナンバーカードの読み取りが必要です。読み取りに必要な「マイナポータルアプリ」を事前にダウンロードしておくと、スムーズに手続きできるでしょう。

マイナポータルを利用できるようになったら、「確定申告の事前準備」ページにアクセスして、取得したい証明書などを選択します。

なお、マイナポータルの「代理人設定」を行っておくと、確定申告を行う際に家族の医療費通知情報も取得できます。

スマホで医療費控除を申請する際、申告書の作成に必要な主な書類・情報は以下の通りです。

マイナポータル連携を行えば、基本的に所得金額や各種控除に関するデータは自動的に反映されます。入力内容が正しいかどうかを確認するために、手元に源泉徴収票や各種控除の証明書を用意しておきましょう。

なお、マイナポータル連携を利用する場合、「医療費通知情報」が添付書類データとして送信されるため、該当する医療費の領収書を保管する必要はありません。

スマホで医療費控除を申請する場合、国税庁の確定申告書等作成コーナーから手続きをします。具体的な手順は、以下の通りです。

なお、スマホでの確定申告のやり方について詳しく知りたい方は、以下の記事もご確認ください。

【関連記事】
スマホの確定申告のやり方を解説！必要な準備や医療費控除など事例別に紹介

まず、確定申告書等作成コーナーから「作成開始」ボタンをタップし、表示される作成のステップを確認のうえ「次へ」をタップします。

会社員で医療費控除の申請を行うのであれば、作成する申告書等を選択する画面で「所得税」を選択します。 個人事業主などで決算書の作成をする場合は、「決算書・収支内訳書」を選びましょう。

また、「マイナポータルとの連携」を選択する項目もあるため、マイナポータルと連携して医療費の情報を取得する人は「連携する」を選んでください。

以下の「申告内容に関する質問」の画面で申告する所得をチェックし「次へ」をタップします。

マイナポータルと「連携する」を選んだ場合、以下の画面で取得した情報の一覧が表示されます。事前に準備した書類と照らしあわせて、金額などが正しい情報であるかを確認しましょう。

なお、証明書などのxmlデータがある場合、この画面でデータの読み込みが可能です。

会社員・パート・アルバイトなどで源泉徴収票がある人は、「給与所得・収入金額」をタップします。マイナポータル連携で情報を取得している場合、収入金額も自動で入力されているため、金額などが正しいかを確認しましょう。

以下のように、スマホやタブレット端末のカメラ機能で読み取って自動反映させる方法もあります。

なお、給与所得が1ヶ所のみ（年末調整済み）で、適用を受ける控除が「医療費控除のみ」など一定の条件に該当する場合、入力項目が簡素化された画面が表示されます。

以下の「控除等入力」の画面まで進んだら、「医療費控除」を選択します。

マイナポータル連携によって自動入力された内容を確認し、必要に応じて修正してください。

訂正や修正がある場合、修正したい部分の訂正をタップして、「実際に支払った医療費額」と「保険などで補填された金額」を入力します。

所得控除に関する入力が完了したら、「税額控除の入力」および「住民税等に関する事項の入力」の画面へ進みます。

税額控除には、「配当控除」や「住宅借入金等特別控除」などがあります。家を購入するために住宅ローンを組んだ場合など、該当する項目を漏れなく入力しましょう。

住民税に関しては、質問の回答に応じて画面が切り替わるため、案内にしたがって入力してください。

所得金額や控除などの入力が完了すると、計算の結果が表示されます。還付される金額がある場合、以下の画面にしたがって還付金の受取方法を選択しましょう。

一方、計算の結果、納めるべき金額がある場合は納付方法を選択します。また、住所・氏名・マイナンバーなどの基本情報を入力するように案内されるため、画面にしたがって入力してください。

最終的な申告内容の確認をしたら、「送信準備」画面に移行します。以下の画面にしたがって、「送信を実行する」をタップ後、「送信完了」と表示されるのを確認します。

申告書の控えは印刷・保存が可能です。万が一、印刷・保存を忘れた場合でも、パソコンからe-Taxにログインすれば申告書等のPDFファイルをダウンロードできます。

医療費控除をスマホで申請するのは、書類の郵送や窓口での手続きが要らないため、手軽で利便性の高い方法です。

スマホでスムーズに確定申告を行うためには、余裕をもって事前準備を済ませておきましょう。

マイナポータル連携を活用することで、必要なデータを入力する手間が省けます。手軽かつ確実に手続きを進めたいなら、積極的に利用しましょう。

確定申告の期間は1ヶ月です。それまでに正確な内容の書類を作成し、申告・納税しなければいけません。

ほかにも、青色申告の場合に受けられる特別控除で、最大65万円を適用するためにはe-Taxの利用が必須条件であり、はじめての人には難しい場面が増えることが予想されます。

そこでおすすめしたいのが、確定申告ソフト「freee会計」の活用です。

freee会計は、〇✕形式の質問で確定申告に必要な書類作成をやさしくサポートします。また、所得額や控除額の計算は自動で行ってくれるため、計算・入力ミスの削減できるでしょう。
ここからは、freee会計を利用するメリットについて紹介します。

確定申告を行うためには、1年間のお金にまつわる取引を正しく記帳しなければなりません。自身で1つずつ手作業で記録していくには手間がかかります。

freee会計では、銀行口座やクレジットカードの同期が可能で、利用した内容が自動で入力されていきます。

日付や金額を自動入力するだけでなく、勘定科目も予測して入力してくれるため、日々の記帳がほぼ自動化でき、工数削減につながります。

会計ソフトでも現金取引の場合は自身で入力し、登録しなければなりません。

freee会計は、現金での支払いも「いつ」「どこで」「何に使ったか」を家計簿感覚で入力できるので、毎日手軽に帳簿付けが可能です。

自動的に複式簿記の形に変換してくれるため、会計処理の経験がない人でも正確に記帳ができます。

さらに有料プランでは、チャットで確定申告について質問ができるようになるので、わからないことがあったらすぐに相談できます。また、オプションサービスには電話相談もあるので、直接相談できるのもメリットの1つです。

freee会計の価格・プランについてはこちらをご覧ください。

各種保険やふるさと納税、住宅ローンなどを利用している場合は控除の対象となり、確定申告することで節税につながる場合があります。控除の種類によって控除額や計算方法、条件は異なるため、事前に調べなければなりません。

freee会計なら、質問に答えることで控除額を自動で算出できるので、自身で調べたり、計算したりする手間も省略できます。

freee会計は取引内容や質問の回答をもとに確定申告書を自動で作成できます。自動作成した確定申告書に抜け漏れがないことを確認したら、税務署へ郵送もしくは電子申告などで提出して、納税をすれば確定申告は完了です。

また、freee会計はe-Tax（電子申告）にも対応しています。e-Taxからの申告は24時間可能で、税務署へ行く必要もありません。青色申告であれば控除額が10万円分上乗せされるので、節税効果がさらに高くなります。

e-Tax（電子申告）を検討されている方はこちらをご覧ください。

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税理士などの専門家に代行依頼をすると、確定申告書類の作成に5万円〜10万円程度かかってしまいます。freee会計なら月額980円（※年払いで契約した場合）から利用でき、自分でも簡単に確定申告書の作成・提出までを完了できます。

余裕をもって確定申告を迎えるためにも、ぜひfreee会計の利用をご検討ください。

スマホで医療費控除を申請する場合、マイナンバーカードやマイナポータルの利用準備が必要です。

詳しくは、「スマホで医療費控除を申請するための事前準備」をご覧ください。

スマホで医療費控除を申請する際は、国税庁の確定申告書等作成コーナーで手続きを行います。

詳しくは、「スマホから医療費控除を申請するやり方（手順）」をご覧ください。